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翻譯:嘉翎(簡介並寄信)
編輯:許馨文(簡介並寄信)


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課程單元
第一部分:系統微生物學-將細胞視成一個完全攪拌反應器
Part I: Systems Microbiology - 'The Cell as a Well-stirred Bioreactor'
1 簡介
Introduction (PDF)

酵素動力學
Michaelis-Menten Kinetics
2 平衡結合
Equilibrium Binding

合作現象
Cooperativity
3 λ嗜菌體
Lambda Phage (PDF)

多穩定性
Multistability

相關MATLAB®檔案
Associated MATLAB® Code File (M)
4 多穩定性(繼續上次課程)
Multistability (cont.) (PDF)
5 合成基因開關
Synthetic Genetic Switches
6 穩定性分析
Stability Analysis (PDF)
7 大腸桿菌的趨化性介紹
Introduction E. coli Chemotaxis (PDF - 1.3 MB)
8 格式化和穩健形趨化性模型的比較
Fine-tuned versus Robust Chemotaxis Models (PDF)

相關MATLAB®檔案
Associated MATLAB® Code File (M)
9 掩飾趨化性
Wrapping up Chemotaxis (PDF)
10 基因震盪器
Genetic Oscillators (PDF)

相關MATLAB®檔案
Associated MATLAB® Code File (M)
11 基因震盪器(繼續上次課程)
Genetic Oscillators (cont.)
12 隨機化學動力學
Stochastic Chemical Kinetics
13 隨機化學動力學(繼續上次課程)
Stochastic Chemical Kinetics (cont.)
第二部分:細胞系統生物學-將細胞視成一個既有濃度梯度的分隔系統
Part II: Cell Systems Biology - 'The Importance of Diffusion and Gradients for Cellular Regulation'
14 細胞系統生物學簡介
Introduction Cell Systems Biology (PDF)

Fick法則
Fick's Laws
15 局部刺激
Local Excitation

整體抑制理論
Global Inhibition Theory
16 局部刺激(繼續上次課程)
Local Excitation (cont.) (PDF)

整體抑制理論(繼續上次課程)
Global Inhibition Theory (cont.)
17 大腸桿菌中快速極間震盪
Rapid Pole-to-pole Oscillations in E. coli (PDF)

相關MATLAB®檔案(1-1)(1-2)
Associated MATLAB® Code File (M - 1 of 2) (M - 2 of 2)

18 大腸桿菌中快速極間震盪(繼續上次課程)
Rapid Pole-to-pole Oscillations in E. coli (cont.) (PDF)
19 真核生物的梯度感應模型
Models for Eukaryotic Gradient Sensing
20 真核生物的梯度感應模型(繼續上次課程)
Models for Eukaryotic Gradient Sensing (cont.) (PDF)
21 細胞骨架動力學建模
Modeling Cytoskeleton Dynamics
22 細胞骨架動力學建模(繼續上次課程)
Modeling Cytoskeleton Dynamics (cont.)
第三部分:發育系統生物學-由單一細胞建構一個生物體
Part III: Developmental Systems Biology - 'Building an Organism Starting From a Single Cell'
23 數量感應
Quorum Sensing (PDF)
24 期末題組諮詢時間
Final Problem Set Question Hour
25 果蠅發育學
Drosophila Development (PDF)

 
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